植物生命各个时期都需要氧气来进行呼吸作用，以释放能量来维持生命活动。以种子的发芽为例，大多数的植物种子发芽时都需要一定氧气。例如大波斯菊、翠菊种子泡于水中，就会因缺氧而呼吸困难，不能发芽，而石竹和含羞草种子可以部分发芽。但是有些种子对氧需求量较少，例如矮牵牛、睡莲、荷花种子可以在含氧量很低的水中发芽。

通常情况下，在土壤板结处进行播种，发芽不好，就是由于土壤的缺氧。植物根系需要进行有氧呼吸，如果栽植地长期积水，就会严重影响到植物的生长发育。因而，在生产上应当特别注意加强对土壤水分的管理。

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